Микробиологическая лаборатория занимает важное место в лечебно-диагностическом процессе — для постановки точной этиологической диагностики бактериальных инфекций, назначения адекватного лечения, раннего выявления и ограничения распространения внутрибольничных штаммов с множественной лекарственной устойчивостью. Приоритетными задачами лаборатории являются поддержание постоянного высокого качества микробиологической диагностики для оптимизации ухода за больным человеком, внедрение новых современных высокотехнологичных методов диагностики.

Лаборатория оснащена современным диагностическим оборудованием, обеспечивающим точную микробиологическую диагностику. Работает с высококачественным и хорошо зарекомендовавшим себя на практике диагностикумом и прочими расходными материалами. Классические методы используются для выделения и обнаружения бактерий путем посева, культивирования, микроскопии и др., а также автоматизированные методы идентификации и определения чувствительности к антибиотикам. Лаборатория участвует в системе внешней оценки качества диагностической деятельности в НЦИПЗ (Национальном центре инфекционных и паразитарных болезней), по которой она сертифицируется дважды в год.

Лаборатория работает с автоматизированной системой идентификации микроорганизмов и определения чувствительности к антибиотикам и МИК (минимальная ингибирующая концентрация) — Erba Mannheim. В лаборатории также есть автоматизированная система исследование гемокультуры — DL Biotech.

В микробиологической лаборатории проводятся следующие микробиологические исследования: микробиологическое исследование для выявления этиологического возбудителя сердечнососудистой системы: гемокультуры, сердечного клапана, сосудистых протезов, внутрисосудистых катетеров и других; дыхательная система: мазок из носа и зева, мокрота, трахеальный аспират, бронхоальвеолярный лаваж и другое; мочеполовая система: моча при естественном мочеиспускании, моча из катетера, пункционная моча, проба из уретрального катетера, вагинальный секрет, цервикальный секрет, уретральный секрет и другие; кожа и подкожная клетчатка: секрет из раны, секрет из операционной раны; секрет из свища, другие материалы из раны; пунктаты: плевральный дренаж, торакальный дренаж, другие дренажи, плевральная пункция, перикардиальная пункция, пункция абсцесса, другие пунктаты и другие материалы: ликвора (спинномозговая жидкость), другие секреты (глаз, уха, полости рта, кожи и др.).

Определение антимикробной чувствительности быстрорастущих микроорганизмов к антибиотикам диско-диффузионным методом и определение МИК к определенным антибиотикам.

Выявление грибка, имеющего медицинское значение, причинителей возникновения кожно-слизистых и системных инфекций на основе их микроскопической морфологии и биохимической идентификации, определение чувствительности к противогрибковым препаратам.

Демонстрация трудно культивируемых микроорганизмов и вызываемых ими заболеваний: анаэробные инфекции, гемофильные инфекции, менингококковые инфекции.

В связи с профилактикой внутрибольничных инфекций в лаборатории также проводятся санитарно-микробиологическое исследование материалов больничной среды, медицинской аппаратуры и медицинского персонала.

Серологическая диагностика включает: АSТ, RF, тесты на сифилис — RPR.